MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome

Total Repeats: 43336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007681	AAT	2	6	721	726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488832
2	NC_007681	AT	3	6	725	730	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
3	NC_007681	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
4	NC_007681	A	7	7	768	774	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
5	NC_007681	A	6	6	821	826	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
6	NC_007681	CCT	2	6	874	879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488832
7	NC_007681	A	6	6	937	942	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
8	NC_007681	AGA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
9	NC_007681	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488832
10	NC_007681	CAA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
11	NC_007681	AGT	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
12	NC_007681	ATTT	2	8	1112	1119	25 %	75 %	0 %	0 %	84488832
13	NC_007681	TTTAAT	2	12	1143	1154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
14	NC_007681	ATG	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
15	NC_007681	AT	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
16	NC_007681	AGT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488832
17	NC_007681	TCC	2	6	1326	1331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488832
18	NC_007681	CAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
19	NC_007681	AAAG	2	8	1363	1370	75 %	0 %	25 %	0 %	84488832
20	NC_007681	TGC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	84488832
21	NC_007681	AGA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
22	NC_007681	TTA	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
23	NC_007681	TCT	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488832
24	NC_007681	GAA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
25	NC_007681	AAG	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
26	NC_007681	ATA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488832
27	NC_007681	TGT	3	9	1581	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488832
28	NC_007681	CAA	3	9	1603	1611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488832
29	NC_007681	ACTT	2	8	1630	1637	25 %	50 %	0 %	25 %	84488832
30	NC_007681	A	7	7	1641	1647	100 %	0 %	0 %	0 %	84488832
31	NC_007681	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
32	NC_007681	AGA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488832
33	NC_007681	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488832
34	NC_007681	AT	3	6	1858	1863	50 %	50 %	0 %	0 %	84488832
35	NC_007681	TCTT	2	8	1962	1969	0 %	75 %	0 %	25 %	84488833
36	NC_007681	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488833
37	NC_007681	ATCA	2	8	2067	2074	50 %	25 %	0 %	25 %	84488833
38	NC_007681	T	6	6	2160	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	84488833
39	NC_007681	TACT	2	8	2177	2184	25 %	50 %	0 %	25 %	84488833
40	NC_007681	CTA	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488833
41	NC_007681	TTG	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488833
42	NC_007681	CA	3	6	2240	2245	50 %	0 %	0 %	50 %	84488833
43	NC_007681	ATTT	2	8	2528	2535	25 %	75 %	0 %	0 %	84488834
44	NC_007681	TAT	2	6	2536	2541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488834
45	NC_007681	TGCT	2	8	2581	2588	0 %	50 %	25 %	25 %	84488834
46	NC_007681	TCA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488834
47	NC_007681	ATG	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488834
48	NC_007681	CTTTTA	2	12	2709	2720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	84488834
49	NC_007681	TCTT	2	8	2743	2750	0 %	75 %	0 %	25 %	84488834
50	NC_007681	AT	4	8	2765	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
51	NC_007681	CAT	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488834
52	NC_007681	AATTT	2	10	2826	2835	40 %	60 %	0 %	0 %	84488834
53	NC_007681	TGG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	84488834
54	NC_007681	TAAAC	2	10	2921	2930	60 %	20 %	0 %	20 %	84488834
55	NC_007681	CAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
56	NC_007681	T	6	6	2981	2986	0 %	100 %	0 %	0 %	84488834
57	NC_007681	TA	3	6	3012	3017	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
58	NC_007681	TGT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488834
59	NC_007681	CAA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
60	NC_007681	AGC	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	84488834
61	NC_007681	ATA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488834
62	NC_007681	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488834
63	NC_007681	TAA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488834
64	NC_007681	AT	4	8	3378	3385	50 %	50 %	0 %	0 %	84488834
65	NC_007681	ATATT	2	10	3417	3426	40 %	60 %	0 %	0 %	84488834
66	NC_007681	CTAAA	2	10	3429	3438	60 %	20 %	0 %	20 %	84488834
67	NC_007681	TTC	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488835
68	NC_007681	TTA	2	6	3604	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
69	NC_007681	GT	3	6	3635	3640	0 %	50 %	50 %	0 %	84488835
70	NC_007681	ACC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	84488835
71	NC_007681	TA	3	6	3773	3778	50 %	50 %	0 %	0 %	84488835
72	NC_007681	ATT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
73	NC_007681	TCT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488835
74	NC_007681	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488835
75	NC_007681	A	6	6	3888	3893	100 %	0 %	0 %	0 %	84488835
76	NC_007681	TAG	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	84488835
77	NC_007681	ACT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
78	NC_007681	CAA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488835
79	NC_007681	TAC	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
80	NC_007681	TAA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488835
81	NC_007681	TAT	2	6	4148	4153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488835
82	NC_007681	CTA	2	6	4181	4186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488835
83	NC_007681	TAAT	2	8	4254	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
84	NC_007681	TCC	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	84488836
85	NC_007681	TTTAA	2	10	4296	4305	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
86	NC_007681	AAT	2	6	4376	4381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
87	NC_007681	ATA	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
88	NC_007681	TCA	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
89	NC_007681	T	8	8	4419	4426	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
90	NC_007681	ATAA	2	8	4428	4435	75 %	25 %	0 %	0 %	84488836
91	NC_007681	T	7	7	4452	4458	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
92	NC_007681	TTG	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
93	NC_007681	T	6	6	4612	4617	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
94	NC_007681	TAA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
95	NC_007681	AT	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
96	NC_007681	AT	3	6	4746	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
97	NC_007681	TAATT	2	10	4775	4784	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
98	NC_007681	T	7	7	4812	4818	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
99	NC_007681	T	6	6	4826	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
100	NC_007681	ATT	2	6	4853	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
101	NC_007681	TAA	2	6	4870	4875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
102	NC_007681	T	6	6	4883	4888	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
103	NC_007681	TTA	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
104	NC_007681	TTATT	2	10	4954	4963	20 %	80 %	0 %	0 %	84488836
105	NC_007681	TGT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
106	NC_007681	ATC	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
107	NC_007681	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
108	NC_007681	AAT	2	6	5030	5035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
109	NC_007681	TAT	2	6	5045	5050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
110	NC_007681	TAA	2	6	5074	5079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
111	NC_007681	ATA	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
112	NC_007681	AATTT	2	10	5191	5200	40 %	60 %	0 %	0 %	84488836
113	NC_007681	TGCAT	2	10	5202	5211	20 %	40 %	20 %	20 %	84488836
114	NC_007681	TAA	3	9	5212	5220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
115	NC_007681	TA	3	6	5239	5244	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
116	NC_007681	AT	3	6	5295	5300	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
117	NC_007681	AT	3	6	5351	5356	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
118	NC_007681	T	6	6	5359	5364	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
119	NC_007681	CTA	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
120	NC_007681	ATT	2	6	5408	5413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
121	NC_007681	TTG	2	6	5445	5450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
122	NC_007681	AAC	3	9	5519	5527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488836
123	NC_007681	TTA	2	6	5535	5540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
124	NC_007681	GTT	2	6	5566	5571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	84488836
125	NC_007681	ATA	2	6	5580	5585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
126	NC_007681	CTT	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	84488836
127	NC_007681	TAA	2	6	5662	5667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
128	NC_007681	ATC	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
129	NC_007681	TTCT	2	8	5726	5733	0 %	75 %	0 %	25 %	84488836
130	NC_007681	TAT	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488836
131	NC_007681	ATA	2	6	5791	5796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
132	NC_007681	ATA	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
133	NC_007681	AAT	2	6	5941	5946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
134	NC_007681	AACAT	2	10	5953	5962	60 %	20 %	0 %	20 %	84488836
135	NC_007681	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	84488836
136	NC_007681	ATA	2	6	6000	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
137	NC_007681	AT	3	6	6023	6028	50 %	50 %	0 %	0 %	84488836
138	NC_007681	TCA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	84488836
139	NC_007681	AAT	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488836
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390	NC_007681	CAA	2	6	15723	15728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	84488844
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397	NC_007681	ATA	2	6	16057	16062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	84488844
398	NC_007681	GA	4	8	16110	16117	50 %	0 %	50 %	0 %	84488844
399	NC_007681	TTA	2	6	16120	16125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	84488844
400	NC_007681	AG	3	6	16184	16189	50 %	0 %	50 %	0 %	84488844
401	NC_007681	AGA	2	6	16196	16201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	84488844
402	NC_007681	CT	3	6	16212	16217	0 %	50 %	0 %	50 %	84488844
403	NC_007681	A	6	6	16224	16229	100 %	0 %	0 %	0 %	84488844
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